מטרת הקורס: הרחבת הבסיס התיאורטי והמעשי של עולם המיקרוביולוגיה עם דגשים על היבטים סביבתיים. הקורס יעסוק בהגדרת המיקרואורגניזמים בעלי חשיבות בתחום המיקרוביולוגיה הסביבתית, טיבן של הסביבות השונות בהן יכולים להימצא אותם המיקרואורגניזמים, הסעה של חיידקים בסביבה, השיטות לניטור מיקרואורגניזמים בסביבה ופעילותם הביולוגית, השפעת המיקרואורגניזמים על הסביבה ועל האדם בדגש על מחזורי החומרים בטבע, השפעתם הבריאותית על האדם, ניצול מיקרואורגניזמים בתהליכי טיוב והשבחה של פסולות שונות, פתוגנים בסביבה.